软件

SAS, SPSS, R语言, R软件, etc.

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StatX 发表于 2014-04-13 10:08 am

搞统计分析的人估计都能说出几条关于SPSS和SAS的区别。

之前主要用SAS,对于SPSS,总的感觉就是界面操作,软件体积不大,安装也简单。当然,SPSS完全可以编程使用。

在内部算法上,SPSS与SAS不太一样。比如之前一个数据,其实就是简单的RxC卡方,8行5列,某此格子数比较小,所以把Fisher也加上,当然我知道这个计算量比较大的,但是结果让我大跌眼镜,SPSS(22e)竟然没算出来,经历几分钟的等待后:

而SAS 9.3的proc freq过程步,chisq/fisher/cmh全加上,几秒钟出结果!

计算能力上,SPSS较SAS确实有差距。当然对于非专业人士,SPSS的功能足够用了,操作简单,是个比较好的选择。


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StatX 发表于 2014-05-26 10:45 am

plotmath中的表达式及其对应的公式如图:

http://imglf1.ph.126.net/apNs1u8uaUSn8oWR11RgYg==/2568177687526077055.png

http://imglf2.ph.126.net/6T6umtpp4ho-idcXKA_XRQ==/1291125718189839707.png

http://imglf1.ph.126.net/VdRRVoLt4Y1UzCiSkhTj6w==/2197475143280955823.png

http://imglf1.ph.126.net/KUzcfPbYBY5Scs9nDE0CaQ==/6598293523100142880.png

http://imglf1.ph.126.net/0rAjQ-H8ixcbDqz9tIwecw==/3238651082133284095.png

例:

formula = expression(italic(Prob) == bgroup("(",atop(n, x),")")%*%p[1]^x%*%(1-p[1])^(n-x))

把上述formula插入到plot中,显示如下:

http://imglf0.ph.126.net/Fen2wJRSylT6-Cw-qwiF4Q==/1816358024814196824.png

虽然比不上LaTex中公式那么漂亮,但在R中无需LaTex支持,这也是不错的选择。

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StatX 发表于 2013-11-21 3:31 pm

SAS 9.2/9.3/9.4的安装文件体积巨大,9.2有5张DVD,9.3有4张,9.4有6张。

以常规方法(终端用户)进行安装时,需要在各个DVD之间进行N多次切换,不胜其烦,估计使用SAS公司提供的DVD进行安装的用户都有这种经历。

如果是正版用户(不知从网上下载的安装文件可否以这种方式安装),可以选择“创建或添加至SAS软件库”的方式进行安装,即在运行Disk1中的setup时,选择管理员任务,而非终端用户任务,如下图:

通过这种方式,先把SAS9.4(or 9.2/9.3)的安装所需文件以软件库的形式释放到你指定的目录,只需依次读取那几张DVD,最后会提示SAS软件订单已成功添加,如下图:

再进行SAS的安装,只需进入软件库所在目录,运行setup即可一次性完成SAS 9.3的安装。而且,以此方式安装SAS时,可以将SAS安装成各种服务器模式,以后有时间会介绍下。


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StatX 发表于 2013-10-20 7:04 am

R软件被越来越多的科研人员用来进行统计计算与分析绘图,其更新速度也是越来越快,虽然使用者感觉到的变化不大。

不知SAS公司有没有压力。今年8月8日发布(也可能是更新的,我在暑假时才看到)的《R的合规性与验证问题-在注册用临床试验中使用R的指南》,给了我们一个明确的信息,R作为一款统计软件,虽然是开源、免费的,但其应用到SAS这种商业软件占据的领域,其验证性可以得到保证。

虽然目前还没有听说有用R软件进行临床试验的统计分析并用于注册的,但随着R的广泛应用和实际检验,FDA或许会公开承认R软件在临床试验中使用的“合法性”。

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StatX 发表于 2017-10-22 10:11 am

下载这个文件:

https://www.cnstat.org/community/sites/old/uploads/2017/10/453166332.rar

文件解压后,把文件3linestable.stt放到下面这个目录中(以SPSS 20为例):

Program Files (x86)\IBM\SPSS\Statistics\20\Looks

然后设置:

Pivot Tables 这个选项卡在未选择之前在最左上角,选择后变成在下面了:

应用并ok之后,再进行统计分析操作,结果输出就是这样的了,效果如下:


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StatX 发表于 2017-07-26 4:50 pm

开放数据标准CDISC,作为FDA注册数据提交的标准之一,在国内受到越来越多人的追捧。

然而,想要摆脱SAS目前来看几乎不可能:

如下图所示:

FDA明确要求,按照CDISC标准生成的数据集,需要以xpt格式提交,而xpt格式文件,恰恰是SAS的XPORT transport format file,一种专用于数据传输的文件格式。

虽然CDISC标准是开放、免费的,但仍然要基于SAS数据传输文件格式来提交,毕竟CDER的人多用SAS做统计分析,拿到xpt文件很简单地就可以转换为SAS数据集。


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StatX 发表于 2013-11-01 9:23 pm

今天拿到了JMP Clinical的安装盘,共4张DVD;SAS的软件,向来不缺体积。

不幸没安装成功,数据盘中提供的SID不是针对Server版操作系统的。不过还是对JMP的核心有了一点点的了解。

特意上Google检索了下,原来JMP早在1989年就诞生了。特点是交互和可视化操作,从JMP的网站上可以看到目前分为JMP、JMP Pro、JMP Clinical 和 JMP Genomics 四个版本。

我的理解,JMP就是以SAS Foundation为核心,整合相应行业中的常用算法和统计方法,具有可视化交互操作功能的统计软件。

或许SAS公司现在正努力推广JMP(想把SPSS彻底打死?)。


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第一种方法:利用sort过程步的dupout和nodupkey,原始的test数据集将输出为_unique和_dups两个数据集。*

proc sort

data = test

out=_unique

dupout = _dups

nodupkey ;

by var;

run ;

第二种方法:在数据步中利用by和first.var and Last.var。注意:此_dups和上面的_dups得到的结果并不相同,实际操作就知道差异在哪里。*

proc sort

data = test;

by var;

run;

data _dups ;

set test;

by var;

if not (first.var and Last.var) then output ;

run;

第三种方法:利用SQL过程步的having count(*),设置条件为>1即可输出重复值;如果要输出没有重复值的,当然是having count(*)=1;此方法得到的_dups与第二种方法相同。*

proc sql;

create table _dups as

select *

from test

group by var

having count(*)> 1

order by var;

quit;

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StatX 发表于 2019-01-26 9:38 am

在SPSS 16及之后的版本,保存结果使用.spv格式,SPSS 15及之前的版本则为.spo。

虽然SPSS当前的版本已经25了,但这不并妨碍你有时会收到SPO文件。

还好,SPSS提供了一个SPO文件查看器:

ftp://ftp.software.ibm.com/software/analytics/spss/support/Stats/Docs/Statistics/LegacyViewer/

根据需要下载所需语言的版本即可。

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在Win10升级到最新版后,SAS 9.4 在启动时出现以下错误信息:

ERROR: The Java child process terminated unexpectedly: status -1073741502.
ERROR: SAS 启动期间未能附加至 Java。

目前SAS公司已经给出修复文件:
http://support.sas.com/kb/60/323.html

可惜,目前SAS给出的补丁只适用于9.4的TS1M3和TS1M4版本。对于TS1M2并未给出解决办法。

对于TS1M2的SAS用户来说,目前还只能这样:

1) 定位到目录 ..\SASHome\SASFoundation\9.4\core\sasext
2) 右键点击tkelsproxy.exe选择属性.
3) 点击“兼容性”面板,将兼容模式中的“以兼容模式运行这个程序”打钩,并选择Windows 8.
4) 点击ok。
5) 重启SAS 9.4.
6) 再次重启 SAS 9.4!

据SAS公司称,Microsoft也将在不久修复这个错误(这个错误本身并非是SAS的,而是因Windows 10升级造成的)。

update:2017-07-16

微软已经发布了更新,问题得到解决。

2017-适用于 Windows 10 Version 1703 的 07 累积更新,适合基于 x64 的系统 (KB4025342)

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